Pogoda de la Vega, Ulrike (2008) Residual restoration of DNA lesions in Deinococcus radiodurans mutants indicate presence of a bypass UV-repair process. PhD, Universität Oldenburg.

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Abstract

The differing UV-susceptibility and UV-damage repair capability of the Deinococcus radiodurans strains and the hypothesis of a bypass repair system have been investigated. The results obtained provide evidence that UV radiation engenders synergistic effects in combination with other stressors like temperature, humidity, desiccation and vacuum. A post-0.5 h-recovery phase was sufficient for wild-type strain to repair up to 80% of the total induced DNA photoproducts. Nucleotide excision repair (NER) is given priority over homologeous recombination repair (HR), based on the fact that 1R1A (recA) resumed repair of bipyrimidine dimers but UVs78 (uvrA-1 uvsE) did not repair any photoproduct type. Not only genetic equipment but also the applied wavelengths influence D. radiodurans' repair efficiency, especially polychromatic UV radiation enables the UV-sensitive class to repair the UV-induced lesions and retain their vitality. Hence, a further pathway must be present that can repair both photoproduct classes. The proposed core genes of the novel bypass system are DR2438, DR2439, DR2441 and DR2444 as well as DR2445, DR2446. Whereas the assertion that DR1200 and DR1891 may act as putative signal factors to initiate the NER- and HR-independent bypass still has to be verified.

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Die durchgeführten Studien belegen, daß UV-Strahlung als synergistischer Umweltfaktor fungiert. Zusammen mit anderen abiotischen Faktoren wie Temperatur, Feuchtigkeit, Trocknung und Vakuum potenziert UV-Strahlung die individuell vorhandene Schadenswirkung erheblich. Nach einem Erholungszeitraum von 0.5 h nach UV-(254 nm)-Bestrahlung erzielte der Deinococcus radiodurans Wildtyp bereits eine Reparaturrate von rund 80% der gesamten induzierten DNA Photoprodukte. Aufgrund der moderat vorhandenen Reparaturrate des Mutantenstammes 1R1A (recA) und der anhaltenden Reparaturunfähigkeit der Doppelmutante UVs78 (uvrA-1 uvsE), erfolgt die UV-Schadenbehebung bevorzugt durch 'nucleotide excision repair (NER)'. Nach Bestrahlung mit polychromatischer langwelliger UV-Strahlung zeigen UV-empfindliche reparatur-defiziente Mutantenstämme eine moderate Reparaturrate der DNA Photoprodukte. Aus diesem Grunde, muss ein weiterer Mechanismus agieren, der beide DNA Photoprodukte gleichermaßen reparieren kann. Aussichtsreiche Kandidaten dieses bisher unbekannten UV-Reparaturprozesses sind DR2438, DR2439, DR2441 und DR2444 sowie DR2445, DR2446, wobei noch experimentell die Rolle der Gene DR1200 und DR1891 verifiziert werden muss.

Item Type:	Thesis (PhD)
Uncontrolled Keywords:	[Keine Schlagwörter von Autor/in vergeben.]
Controlled Keywords:	UV-Strahlung, DNA-Schaden, Reparaturprozess, Deinoccus radiodurans
Subjects:	Science and mathematics > Life sciences, biology
Divisions:	Faculty of Mathematics and Science
Date Deposited:	17 Jan 2013 14:22
Last Modified:	08 Jul 2013 13:04
URI:	https://oops.uni-oldenburg.de/id/eprint/749
URN:	urn:nbn:de:gbv:715-oops-7852
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