Schatz, Stefanie (2025) Die Bedeutung umfassender Molekulardiagnostik mittels Hybrid Capture Next Generation Sequencing beim nicht-squamösen NSCLC. PhD, Universität Oldenburg.

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Abstract

Der Fortschritt der molekularpathologischen Charakterisierung von Lungenkarzinomen hat zu einer deutlichen Verbesserung der Behandlungsoptionen geführt. Vor allem Adenokarzinome der Lunge sind häufig durch somatische Treibermutationen gekennzeichnet und können somit gezielt mit Tyrosinkinaseinhibitoren (TKI) behandelt werden. Auch neue Biomarker wie die Tumormutationslast (TMB) können durch die technologische Weiterentwicklung analysiert werden und wegweisend für die Behandlung sein. Um eine vollumfängliche Diagnostik und somit ein optimales Therapiemanagement zu gewährleisten, bietet sich das Next Generation Sequencing (NGS), welches sowohl für Gewebe- als auch Flüssigbiopsien etabliert ist, an. Ziel dieser Arbeit ist, die NGS-basierte Mutationsanalytik im Routinealltag zu evaluieren. Dabei werden sowohl praktische Aspekte, wie die Dauer vom Materialeingang bis zum Befund, als auch der Informationszugewinn auf molekularer Ebene und dessen Auswirkung auf die Therapie erläutert. Das TMB wird mit anderen molekularen Markern korreliert und das Resistenzspektrum von Tumoren in Abhängigkeit der TKI-Therapiesequenz untersucht.

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The significance of comprehensive molecular diagnostic using Hybrid Capture Next Generation Sequencing in non-squamous NSCLC

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The improvement of molecular genotyping of lung cancer has led to a significant specification of treatment options and is routinely used to guide clinical care of lung adenocarcinoma patients. Lung adenocarcinomas are often characterized by the presence of somatic driver mutations. Based on this, the tumor can be treated individually with targeted therapy such as tyrosine kinase inhibitors (TKI). New biomarkers such as tumor mutation burden (TMB) can also be analyzed through technological advancements and can guide the treatment strategy. Next generation sequencing (NGS), which is established for both tissue and liquid biopsy, is an ideal tool to ensure fully comprehensive diagnostics and thus optimal therapy management. The aim of this work is to evaluate NGS-based mutation analysis in routine practice. Practical aspects, such as the turn-around time from start of HC NGS workflow to reporting, as well as the information gain on the molecular level and its impact on therapy will be explained. TMB will be correlated with other molecular markers and the spectrum of resistance-conferring mutations will be examined in relation to TKI therapy sequence.

Item Type: Thesis (PhD)
Uncontrolled Keywords: Lungenkarzinom, Molekulardiagnostik, Mutationsanalyse, Next Generation Sequencing, Biomarker
Subjects: Technology, medicine, applied sciences > Medicine and health
Divisions: Faculty of Medicine and Health Sciences > Department of Human Medicine
Date Deposited: 24 Feb 2025 10:43
Last Modified: 24 Feb 2025 10:43
URI: https://oops.uni-oldenburg.de/id/eprint/7138
URN: urn:nbn:de:gbv:715-oops-72198
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