Kunze, Vincent P. (2017) Genetic profiling of a cone-dominated retina and cone photoreceptor subtypes. PhD, Universität Oldenburg.

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Abstract

Most mammals have two types of cone photoreceptors, S- and M-cones. They diverge in their sensitivity to different wavelengths of light. Here I report transcriptomic differences in cone subtypes and genes that are potentially involved in cone synapse formation. For this, I manually collected single cells from the ground squirrel that, in contrast to mouse, is diurnal and has a cone-dominated retina. The analysis of the transcriptome revealed differentially expressed genes. I presented immunohistochemical evidence for the applicability of the data. In addition, I tested AAV-delivered GFP-expression in the squirrel retina which paves the way for functional studies in this model. In tree shrew, I described morphological and transcriptomic changes during retinal development compared to mice. There were subtle differences in the onset of transcription factors and in the relative timepoints of photoreceptor genesis. In addition, I looked at differences in mRNA expression in cones of the hibernating ground squirrel. I identified differentially expressed genes that may play a role in the adaptive changes of photoreceptor morphology during hibernation.

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Genetische Charakterisierung einer zapfendominierten Retina und von Zapfenphotorezeptor-Subtypen.

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Die meisten Säugetiere besitzen zwei Arten von Zapfen in der Retina, S- und M-Zapfen. Sie unterscheiden sich in ihrer Empfindlichkeit gegenüber verschiedenen Lichtwellenlängen. In dieser Arbeit habe ich transkriptomische Unterschiede in Zapfentypen festgestellt. Dafür habe ich manuell einzelne Zellen des Dreizehnstreifen-Hörnchens gesammelt, welches im Gegensatz zur Maus tagaktiv ist und eine zapfendominierte Retina besitzt. Die Analyse zeigte differentiell exprimierte Gene, von denen ich einzelne immunhistochemisch nachwies, um die Anwendbarkeit der gewonnenen Daten zu demonstrieren. Zusätzlich testete ich die AAV-vermittelte GFP-Expression in der Retina des Dreizehnstreifen-Hörnchens, was den Weg für funktionelle Studien in diesem Modell ebnet. Im Spitzhörnchen beschrieb ich morphologische und transkriptomische Veränderungen während der Netzhautentwicklung im Vergleich zu Mäusen. Es gab Unterschiede im Einsetzen der Expression von Transkriptionsfaktoren und bei der der Photorezeptorgenese. Zusätzlich untersuchte ich die mRNA-Expression in Zapfen des Dreizehnstreifen-Hörnchens während des Winterschlafs. Ich identifizierte differentiell exprimierte Gene, die eine Rolle bei den adaptiven Veränderungen der Photorezeptormorphologie während des Winterschlafs spielen könnten.

Item Type:	Thesis (PhD)
Uncontrolled Keywords:	Photorezeptor, Zapfenzelle, Netzhaut, RNS, Hörnchen
Subjects:	Science and mathematics > Life sciences, biology
Divisions:	Faculty of Mathematics and Science > Department of Biology and Environmental Sciences (IBU)
Date Deposited:	23 Mar 2018 09:34
Last Modified:	27 Mar 2018 10:40
URI:	https://oops.uni-oldenburg.de/id/eprint/3571
URN:	urn:nbn:de:gbv:715-oops-36521
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