Rütters, Heike (2001) Tracing viable bacteria in Wadden Sea sediments using phospholipid analysis. PhD, Universität Oldenburg.

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Abstract

This thesis describes a protocol that was developed to analyse different types of lipids from bacteria and sediments. Special emphasis was placed on the analysis of intact phospholipids by HPLC-ESI-MS/MS, because phospholipids appear to be suitable biomarkers to trace viable bacteria. The specificity of phospholipids as biomarkers was tested by investigating the lipid composition of 30 different strains of sulfate-reducing bacteria. A sediment core with a length of 55 cm, studied in this thesis work, was taken from an intertidal flat close to Neuharlingersiel (NW Germany). Results from geochemical investigations were compared to data obtained by microbiological techniques. Highest amounts of phospholipids as well as of other types of glycerides were measured and decreased rapidly within the upper few centimetres. Nevertheless, intact phospholipids could still be detected at a sediment depth of 50 cm indicating the presence of intact cells.

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In der vorliegenden Arbeit wurde eine Methode entwickelt, um verschiedene Lipidtypen aus Bakterien und Sedimenten zu analysieren. Der Schwerpunkt lag auf der Analyse intakter Phospholipide mittels HPLC-ESI-MS/MS, da Phospholipide potentielle Biomarker für 'lebende' Bakterien darstellen. Die Spezifität der Phospholipide als Biomarker wurde exemplarisch durch die Untersuchung der Lipidzusammensetzung verschiedener sulfatreduzierender Bakterien getestet. Des weiteren wurde ein Sedimentkern von 55 cm Länge aus dem Spiekerooger Rückseitenwatt untersucht. Die mittels geochemischer Verfahren erhaltenen Ergebisse wurden mit Daten aus mikrobiologischen Untersuchungen verglichen. In dem untersuchten Sedimentkern wurden die höchsten Gehalte an Phospholipiden und anderen Glyceriden an der Oberfläche gemessen. Schon innerhalb der ersten Zentimeter fielen diese Werte stark ab. Trotzdem wurden selbst in 50 cm Tiefe noch intakte Phospholipide gefunden, d.h. es gab dort noch 'lebende' Zellen.

Item Type: Thesis (PhD)
Uncontrolled Keywords: [Keine Schlagwörter von Autor/in vergeben.]
Controlled Keywords: Watt, Bakterien
Subjects: Science and mathematics > Chemistry
Divisions: Faculty of Mathematics and Science > Department of Chemistry (IfC)
Date Deposited: 17 Jan 2013 14:17
Last Modified: 05 Dec 2013 13:43
URI: https://oops.uni-oldenburg.de/id/eprint/347
URN: urn:nbn:de:gbv:715-oops-3770
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