Bernhardt, Nadine (2016) Analysis of phylogenetic relationships among diploid Triticeae grasses. PhD, Universität Oldenburg.

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Abstract

The grass tribe Triticeae consists of about 360 species and several subspecies in approximately 20-30 genera. The tribe harbours the important cereals bread wheat (Triticum aestivum), barley (Hordeum vulgare), rye (Secale cereale), and their wild relatives. In this thesis a hybridization-based enrichment approach coupled with Illumina sequencing was developed that retrieves phylogenetic sequence information from 451 putative single-copy loci from all taxa of the tribe. The nuclear loci were studied individually and in multilocus datasets and different phylogenetic methods (e.g. network and coalescent-based) were applied. The results identify distinctions among Triticeae genomes. Moreover, they improve our understanding of the relationships among these taxa and of the sequence of speciation events.

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Analyse phylogenetischer Beziehungen zwischen diploiden Triticeae Gräsern

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Die Tribus Triticeae besteht aus etwa 360 Arten mit vielen Unterarten in ca. 20-30 Gattungen und umfasst die Getreidearten Brotweizen (Triticum aestivum), Gerste (Hordeum vulgare), Roggen (Secale cereale), sowie ihre wilden Verwandten. In dieser Arbeit wurde ein Anreicherungs-Ansatz auf dem Prinzip der Hybridisierung in Verbindung mit Illumina Sequenzierung entwickelt, um phylogenetische Informationen von 451 nukleären single-copy Loci aller Triticeae Taxa zu erhalten. Die Loci wurden einzeln und in multilocus Datensätzen unter Gebrauch verschiedener phylogenetischer (z.B. netzwerk- und koaleszenz-basierter) Methoden untersucht. Die Ergebnisse zeigen Unterschiede zwischen Triticeae Genomen und verbessern unser Verständnis über die Verwandtschaftsbeziehungen zwischen diesen Taxa sowie über die Abfolge von Artbildungssereignissen.

Item Type: Thesis (PhD)
Uncontrolled Keywords: Triticeae, Phylogenie
Subjects: Science and mathematics > Science
Science and mathematics > Life sciences, biology
Divisions: Faculty of Mathematics and Science > Department of Biology and Environmental Sciences (IBU)
Date Deposited: 27 May 2016 10:55
Last Modified: 30 May 2016 09:18
URI: https://oops.uni-oldenburg.de/id/eprint/2792
URN: urn:nbn:de:gbv:715-oops-28739
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