Köpke, Beate (2007) Verteilung, Zusammensetzung und Aktivitäten mikrobieller Gemeinschaften in Wattsedimenten von der Oberfläche bis in mehrere Meter Tiefe. PhD, Universität Oldenburg.

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Abstract

In dieser Arbeit wurden die Zusammensetzung und Aktivitäten mikrobieller Gemeinschaften in Sedimenten des Rückseitenwatts der Insel Spiekeroog untersucht. Dazu wurden bis zu 550 cm lange Sedimentkerne mikrobiologisch, molekularbiologisch und geochemisch analysiert. Die höchsten Lebendkeimzahlen in Ansätzen mit Metalloxiden als Elektronenakzeptoren weisen auf die Dominanz von (fakultativen) Anaerobiern in diesen Sedimenten hin. Auch die Mehrheit der 112 Isolate, die sieben phylogenetischen Gruppen zugeordnet wurden, waren fakultative oder strikte Anaerobier. In den oberflächennahen Sedimenten dominierten Vertreter der Proteobacteria, in den tieferen Firmicutes. Zwei Stämme wurden als neue Arten, Roseobacter pelophilus sp. nov. und Roseovarius pelophilus sp. nov., vorgeschlagen. Die höchsten mikrobiellen Aktivitäten wurden nahe der Sedimentoberflächen gemessen. Exoenzymaktivitäten und Sulfatreduktionsraten nahmen mit der Tiefe ab, wobei letztere sogar in 500 cm Sedimenttiefe nachgewiesen wurden. Die höchsten Netto-Sulfatreduktionsraten wurden allerdings in den Übergangszonen von Sulfat und Methan verzeichnet.

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This paper describes the composition and activities of microbial communities in tidal sediments of the backbarrier area of Spiekeroog Island. Up to 550 cm long sediment cores were recovered and the samples were analysed applying microbiological, molecular biological and geochemical methods. Bacterial viable counts were achieved using media containing metal oxides as electron acceptors. This indicates that the sediment were dominated by (facultative) anaerobes what was confirmed by analysis of the extensive culture collection comprising of 112 strains affiliating with seven different phyla. Surface-near sediments were dominated by Proteobacteria, deeper layers by Firmicutes. Two of these strains were proposed as new species, Roseobacter pelophilus sp. nov. and Roseovarius pelophilus sp. nov. Microbial activities were throughout the whole sediment column, even as deep as 500 cm. Generally, sulfate reduction rates and exoenzyme activities strongly decreasing with depth, although highest net sulfate reduction rates were found in the sulfate-methane transition zones.

Item Type:	Thesis (PhD)
Uncontrolled Keywords:	[Keine Schlagwörter von Autor/in vergeben.]
Controlled Keywords:	Wattsediment, mikrobielle Gemeinschaft
Subjects:	Science and mathematics > Life sciences, biology
Divisions:	Faculty of Mathematics and Science > Institute for Mathematics (IfM) Faculty of Mathematics and Science
Date Deposited:	17 Jan 2013 14:12
Last Modified:	17 Jan 2013 14:12
URI:	https://oops.uni-oldenburg.de/id/eprint/26
URN:	urn:nbn:de:gbv:715-oops-566
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